[科研]上海巴斯德所崔杰团队应用单细胞转录组技术强调了...

一稔

10月28日，Lancet旗下国际期刊eBioMedicine 在线发表了中国科学院上海巴斯德研究所崔杰研究组题为Single-cell RNA sequencing highlights the functional role of human endogenous retroviruses in gallbladder cancer的最新研究成果。

胆囊癌 （GBC）是最常见的胆道癌症，其特点是早期诊断困难、发展迅速、总体预后较差，需要继续寻找早期诊断标志物和开发新的治疗策略。人类内源性逆转录病毒（human endogenous retrovirus, HERV）是古老的逆转录病毒整合在人类祖先基因组并通过孟德尔遗传定律遗传下来的病毒“化石”，约占人类基因组的 8%。HERV 在多种癌症中被特异性地激活并与癌症发生发展相关联，近年来探索 HERV 作为诊断标记物和治疗靶点的潜力逐渐引起世界关注。目前，HERV与GBC的关联尚不清楚，并且单细胞数据缺乏HERV类标识物，因此崔杰课题组联合东方肝胆医院、东方医院等单位，共同探究HERV在GBC中的单细胞水平转录模式及其对细胞功能的潜在影响。

该研究应用单细胞转录组测序技术揭示了胆囊癌的肿瘤微环境的细胞组成，绘制了HERV在各种细胞类型中的转录图谱，证实了HERV在胆囊癌中的异常活化且具有细胞类型特异性以及不同的HERV家族关联的细胞功能存在差异。该研究通过实验证实了HERV可以发挥增强子的功能，从而改变HERV邻近基因的表达模式。该研究基于HERV的转录特征提出HERVH（HERV家族H类）可作为GBC潜在的早期诊断生物标记物以及HERVH衍生的免疫检查点HHLA2有希望成为GBC的免疫治疗靶点。这些发现突出了HERV在塑造肿瘤微环境中的重要作用，为更好理解胆囊癌的发生发展提供了医学新见解。